哥斯拉突然從北極的冰中出現！哥斯拉擊沉核潛艇海洋號，更破壞北極的軍事基地後開始南下。同樣的時候，在太平洋製藥宣傳部，那公司為提高節目的收看率打算使用發俄島上的魔神，櫻井和古江的兩名宣傳人員便去了發俄島。他們發現島上出現的魔神就是金剛。於是把他弄暈帶到日本，不久在運送金剛的船遭日本政府攔截，但那時金剛突然從麻醉中甦醒，在運輸船上跑出來，游向日本，而且更在那須高原初次與哥斯拉對決。第1回合以哥斯拉的放射火焰取得勝利，金剛被打敗嗎？同時自衛隊正進行「火焰攻擊大作戰」，把汽油倒入河中然後燃點著火，哥斯拉竟然沒有直接渡過河流。不過哥斯拉在高壓電流前竟不能突破，還被嚇走了。另一方面，逃走了的金剛面對阻擋哥斯拉的電塔竟輕易被他突破，而且在發瘋地吃著美味的電流，金剛終於到達市中心，更捉了櫻井的妹妹作為人質登上國會會議廳，自衛隊便利用法羅島體細胞莓汁展開「美味果汁迷迷糊糊大作戰」莓汁從天而降，在空中爆炸灑落在金剛身上，令金剛暈倒了。自衛隊防止金剛破壞城市，又展開「氣球輸送大作戰」，大氣球綁在金剛身上，帶著牠往富士地區，被運送到富士高原的金剛，與哥斯拉再次決鬥，哥斯拉再把金剛打倒，更放出放射火焰令森林著火。幸好有股雷暴經過，閃電擊中金剛，電流被吸進金剛身體中，令他醒來，變成超級撒亞人般。金剛再戰哥斯拉，金剛使出雷擊拳，雙手找著哥斯拉的尾巴，然後三百六十度一轉把哥斯拉拋到另一處再戰，把熱海城徹底破壞，最後2頭怪獸更滾下山跌入海中。不久在海上只看到金剛的身影，哥斯拉被打敗了。其實東寶為了不想得罪美國，在故事中，哥斯拉是被打敗，但為鞏固哥斯拉在日本怪獸王的地位，卻在官網寫成平手！哥斯拉和金剛共戰3場，富士山1敗，電塔1勝，熱海城1勝。

素直子收到一封冲绳来信，来信人大村鹤男自称可能是她的异母哥哥，素直子于是和父亲的未婚妻桃子一起来到冲绳游玩，想借机寻找哥哥。而鹤男曾经见过桃子，把当作了妹妹，对素直子反倒没什么感情。桃子背叛了未婚夫，和鹤男相恋。素直子偶然结识了也有可能是大村鹤男父亲的国吉，国吉和素直子的父亲菊地是大学同学，鹤男不知是他们谁的孩子。当年曾经对立的国吉和菊地，今天已经是冲绳和东京的上层要人了，对这些过去的纠葛一笑了之应该是他们最合适的态度了。冲绳和日本的关系，在这个血缘故事中得到了隐喻的反映。

福建沿海一个不起眼的小镇，偷渡之风屡禁不止。为了一圆美国发财梦，当地人倾家荡产，甚至为此丢掉性命。镇上名人二弟（段龙 饰）也曾是偷渡大军中的一员，当年他成功踏上美国的土地，并和当地开饭馆的同乡的女儿生有一子。然而这件事却导致他美国梦的破灭，愤怒的老丈人向移民局检举，二弟最终被遣返回国。回到家乡后的他百无聊赖，沉默压抑，只有当巡回演出的越剧团到来时，团中的美丽旦角（舒砚 饰）才令他感到短暂的宽慰。不久，二弟在美国的儿子福生回国省亲。在哥哥的劝说下，他终于鼓起勇气前去探望儿子。然而，势利的老丈人却以法律为由禁止这对父子见面。思子心切，二弟不惜铤而走险……

客家年轻人小伟（范植伟饰）和小杰（高盟杰饰），一个性情沉静，一个个性冲动，他们在灰暗简陋的大宅里成长。血气方刚的小伟崇拜李小龙，舞动双截棍强健身体。与他感情亲密的姐姐小敏（吴雨致饰），因患上癌症，终日被折磨，与死神搏斗。小杰是小伟的表弟，因对生活的不满，人有些神经质，沉迷于魔术。两个年轻人似乎随着姐姐的病情，寻不着人生的方向。他们就跟鱼缸里的热带鱼一样，看似自在的游动，却逃不出一层玻璃。一次小杰得到一把枪，他装腔作势地耍弄，却最终闯下大祸。二人被黑帮追杀，狂奔逃命……