分手，不分手

最近，在曼哈顿发生了一连串的离奇死亡事件，而这些事件的主要责任竟要归结到一对对此毫不知情的昆虫学家夫妇苏珊（米拉·索维诺 Mira Sorvino 饰）和皮特（杰瑞米·诺森 Jeremy Northam 饰）的身上。原来，为了抵抗曾经在曼哈顿肆虐的疫情，苏珊和皮特创造出了一种名为“犹大”的昆虫，这种人造昆虫没有繁殖的能力，却能够消灭病毒的携带体蟑螂。令两夫妇没有想到的是，在犹大的体内发生了未知的变异，使得它不仅拥有了繁殖后代的能力，甚至可以化身成人类的模样进行狩猎，而它们的猎物不是别人，正是人类本身。作为犹大的“父母”，苏珊和皮特义不容辞的担负起了消灭它们的责任，在地铁系统专家雷纳德（查尔斯·达顿 Charles S. Dutton 饰）的帮助下，一行人向着犹大在地下的老巢进发了。

小镇上，有放洋流学回来的假洋鬼子，借西方文明的优越感，处处欺压村民。小子张小泰利用中国功夫，与假洋鬼子唐罗拔争女友，先破西洋拳，再败日本剑道，大胜西洋剑。

20世纪中叶，不同国家多名神父惨遭邪恶力量杀害。为了查清真相，教廷再次找到曾与魔鬼修女瓦拉克（邦妮·阿伦斯 Bonnie Aarons 饰）对决并生还的艾琳修女（泰莎·法米加 Taissa Farmiga 饰）进行调查。难以抗命的艾琳修女只得上路，与之同在一家修道院的黑人修女黛博拉（斯托姆·瑞德 Storm Reid 饰）则执意同行。与此同时，当初曾从鬼修女手中救下艾琳姓名的法国向导弗兰奇（乔纳斯·布洛凯 Jonas Bloquet 饰）正在一所教会学校工作，平静的日子里，他和一名女孩成了忘年交，也和女孩的母亲暗生情愫。但是这所学校的废弃教堂内，似乎隐藏着什么不为人知的秘密。邪恶的力量慢慢袭来，鬼修女图谋复仇的日子迫在眉睫……

城市在恢复平静后，大反派重新召集旧部卷土重来，并勾结外星恶势力朗格试图称霸地球，忍者神龟莱昂纳多（皮特·普劳泽克 Pete Ploszek 饰）、拉斐尔（阿兰·里奇森 Alan Ritchson 饰）、多纳泰罗（杰瑞米·霍华德 Jeremy Howard 饰）和米开朗基罗（诺尔·费舍 Noel Fisher 饰）与女记者艾蓓丽尔·奥尼尔（梅根·福克斯 Megan Fox 饰）、韦恩·芬威克（威尔·阿奈特 Will Arnett 饰），及面具义警凯西·琼斯（斯蒂芬·阿梅尔 Stephen Amell 饰）并肩作战打击恶徒。在史莱德（布莱恩·泰 Brian Tee 饰）逃脱拘留后，他与疯狂的科学家巴克斯特斯·托克曼（泰勒·派瑞 Tyler Perry 饰）及其两个笨拙的左膀右臂猪面和牛头联合，发布了一个控制世界的恶魔计划。在神龟们与史莱德及其同伙对抗的同时，他们发现自己正面临着一个更邪恶的力量大反派格朗，神龟们面对的将是宇宙级的强大对手。