疯狗、马丁、杨威、猪木等几个眷村的年轻人，整日不读书，成群结队的在村子里消遥放荡，日子过的非常快乐。由於团结封闭的心态，所以对眷村外的人都视如仇敌，时常有打架纠纷等事情发生。村子里的女孩小笛与花痴经常是这群不良少年打架的导火线，每次都让家长们头痛万分，也不知道如何教导。 有一天，眷村中失火了，他们一起出动热心救火，却被邻居误认为是纵火凶嫌，怎麼解释也没人相信他们，最後在老家混不下去了，四人雄心勃勃的想到台北打天下，误认为以他们的力量在都市里可以结党称王，所以每到一个地方就想全面占领，闹出不少的笑话。 最後，幼稚的幻想被现实打败破灭，只好将这一段成长的经验，重新装进行囊，再回到乡下的眷村去了。

在一个阳光明媚的日子里，草帽海贼团的伙伴们正在某个海滩悠闲度假。然而泊在岸边黄金梅利号就在他们鼻子底下被人偷走。一个礼拜后，他们仍旧灰溜溜地在海上漂泊。正在为难之时，路修等人遇见小毛贼博洛德和阿基斯。这二人正打算前往发条岛盗取名贵的钻石钟，而黄金梅利号很可能就是盘踞岛上的扑克牌海贼团所窃。不久他们遇见扑克牌海贼团的船队，然首次交手便告失利，娜美更被对方虏去。为了找回船和同伴，并得到钻石钟，草帽海贼团与盗贼兄弟燃气斗志，向发条岛挺进……本片根据日本漫画家尾田荣一郎的同名原著改编，是2001年上映的第二部动画剧场版，尾田同时担任作画监督。

After secret agent Michael Scarn (played by Scott) is forced into retirement due to the death of his wife Catherine Zeta-Scarn, the President of the United States of America (played by Darryl Philbin) requests that he prevent Goldenface (played by Jim Halpert) from blowing up the NHL All-Star Game and killing several hostages. Scarn goes undercover and learns how to play hockey, killing another hockey player (played by Oscar Martinez) to make it into the game, but after confronting Goldenface, he is shot. He later recuperates but learns that the President was in on it all along. Depressed, he goes to a bar to drown his sorrows. The patrons of the bar sing a song called "The Scarn" which he danced to with his wife, which cheers Scarn up immensely. With his courage restored, Scarn is able to save the day and blow up Goldenface in the process.

ある日、沖縄の海に奇怪な生物が現れた。オニヒトデを思わせる「それ」は毒液で漁師を負傷させ、瞬く間に日本全域に広がった。それは伝説のニライカナイの古代文明が環境汚染の解決の為の生体浄化システムとして生み出したが、暴走したために結果としてニライカナイの滅亡の一因となった怪獣ダガーラの復活の前兆であった。エリアス姉妹は地球の危機を察知して石垣島へ飛ぶと、そこにはニライカナイから来た小生物ゴーゴが出現し、その尾の装飾リングから宝がある事を悟った本土からの密猟者と、ゴーゴを保護した地元の少女たちがいた。エリアス姉妹は「ニライカナイの遺跡にはダガーラを倒す秘宝がある」という伝説を知っていた。少女たちとエリアス姉妹、そして姉妹と対立する黒い妖精ベルベラと密猟者はそれぞれ組んで海へ出る。ゴーゴの手引きでニライカナイの遺跡であるピラミッドが海から出現した。だが、宝捜しをしている頃、石垣島にダガーラが上陸し暴れ出したため、エリアス姉妹はモスラを召喚して戦いを挑む。ダガーラとモスラは石垣島から西表島まで空中戦を繰り広げ、遺跡のピラミッド付近で海中戦となり、モスラは海での戦いを得意とするダガーラに海に引きずり込まれた。そしてダガーラは「それ」 = 無数のベーレムをモスラに取り付かせ、モスラは戦闘不能に陥った。エリアスは必死にモスラに取り付いたベーレムを剥がそうと試みるが、あまりにも沢山付いているため、全くきりがない。絶体絶命のピンチに陥ったモスラ、宝の発見は急務となった。遺跡の中のトラップをくぐり抜けた少女たちと密猟者は、辿りついたホールでニライカナイの王女の立体映像から「ゴーゴが宝の主として少女 = 汐里を選んだ」事を告げられる。だが、ダガーラはピラミッドを襲撃してきた! 崩壊するピラミッドの最中、モスラはゴーゴの「命の水」の力により、取り付いたベーレムは取り払われ、さらにレインボーモスラとなってパワーアップし、再びダガーラと再戦する。さっきまでの状況とは一変し、今度はモスラが優位に立った。ダガーラが再び海中に潜った時、モスラはアクアモスラに変身し、戦いの舞台は、海底に移った。ダガーラの攻撃をバリアーでガードし、ダガーラに強力な攻撃を与えるモスラ。さらに分身モードとなり、ダガーラの体内から、ベーレムを倒しながら攻撃し、遂にダガーラは倒れ、その後、ピラミッドと共に消滅。モスラも海から出てきた後、元の姿のレインボーモスラに戻り、インファント島に帰って行き、危機は去ったのであった。