清明时节，梁绍宗利用春假随父亲梁道宗归乡扫墓，住在孀居的姑母家中。姑母只有一女，名叫林芬，青梅竹马的表兄妹见面，分外高兴。时值军阀混战，战火殃及林芬家乡，林芬惨遭奸污。不久，道宗将林芬母女接进城，准备为绍宗和林芬完婚。林芬心存不安，将所有的情况写了一封信给绍宗，不料信被绍宗的弟弟藏起，林芬以为绍宗已经了解了情况，并且能够接受，于是同意结婚。新婚之夜，道宗无意中看到了这封信，大怒，执意退婚。但绍宗了解了事实真相后，依然带林芬离开家庭，去开创新的生活。

妈祖娘娘出生便与众不同，不哭不闹，且有元神护身，海中来的水母怪想对刚出生的默娘不利时，元神便显现将水母怪赶跑，而打斗过程中，水母怪碰落烛台而点燃了窗帘，虽然家人即时扑灭，但仍使默娘受到惊吓，从此开始惧怕火。默娘从小聪明善良喜欢帮助别人，也很关心渔民的艰苦生活，十二岁跟随父母到寺庙烧香时，得到观音菩萨的指引，并拜仙道玄通为师学习法术。在前往上山学艺的途中，默娘碰到水精千里眼与金精顺风耳想将默娘带回当媳妇，逃跑过程中默娘受到惊吓而昏倒，所幸元神即时显现并未使其得逞，并将两人收服缩小，从此便跟随在默娘左右成为其护法。跟随玄通修习法术的过程中，默娘非常用功，但由于有怕火的毛病，逃避修练任何与火有关的法术，使得风、火、雷、电四种法术中的三昧之火一环无法完善，也为日后埋下隐患。有天，哥哥弘毅在野外迷失方向并摔伤了脚，默娘及父亲在寻找哥哥的过程中发现了黑夜中些微光线对辨别方向的重要性，从此她不畏风雨及黑夜的恐惧在海岸边尽力帮助归航的渔船识别方向，点燃灯火指引他们归航，让村里的渔民得到莫大的帮助。一日，默娘的父兄为了要帮默娘大姐办置嫁妆而出海，结果渔船在夜晚归航途中碰到大风浪，迷失在漆黑的海面上，默娘运用法术使元神出窍帮助哥哥掌舵，却被不知情的母亲因担心默娘陷入恶梦而打断，导致哥哥不幸落水身亡。为了帮助父亲和其他被围困在海上的渔船辨别方向，默娘引火将自家后院的柴房燃烧作为渔船辨别方向的光，但制造风浪的元凶三头怪却布下了乌云结界，使被困船只无法看到火光，只有三昧之火才能够穿透结界，但默娘因怕火而修练不精所以无法使用，在关键时刻玄通牺牲自我引导默娘，终于帮助她点燃三昧之火，默娘运用风、火、雷、电法术成功收服三头怪，并且引导渔船归航，拯救了渔民和自己的父亲，然而因降妖过程中过度劳累而失去了生命。默娘死后，元神不能在人世间停留太久，默娘的元神渐渐变得透明，也代表着她即将要离开，当她准备升天时，三头怪控制了龙王向人类发起大规模的进攻，默娘使尽所有法术，才将灾难平息，自己却也烟消云散。慈悲的观音菩萨超渡了默娘的元神，并且帮助默娘成仙，成为人类在海上的守护神——妈祖娘娘。

在大公司纽斯特德的支持下，生物科学家克里夫·尼科利（阿德里安·布洛迪 Adrien Brody 饰）和女友艾尔莎·卡斯特（萨拉·波莉 Sarah Polley 饰）进行基因重组的实验，并取得初步进展。然而由于资金和公众舆论等原因，纽斯特德高层决定中断对他们现有研究的支持。克里夫和艾尔莎不愿半途而废，于是偷偷展开实验。他们对基因进行优化重组，并混入了艾尔沙的一部分基因，终于孕育出一个相貌奇特的雌性怪物。秉着科学家的道德和良知，克里夫执意要杀死怪物，而艾尔莎则全力保护，视若己出，并将其命名为卓伦。卓伦以飞快的速度成长，最终变成一位拥有独特美感的女孩（Delphine Chanéac 饰）。在这一过程中，克里夫和艾尔莎越陷越深……

北条司的经典动漫作品《城市猎人》剧场版制作决定！城市清道夫冴羽獠重出江湖！原版声优神谷明&伊仓一惠回归，《妖怪手表》系列的加藤阳一担任编剧，児玉谦次导演，影片将于2019春季上映。