故事发生在十九世纪末，富家子弟伊格纳茨（拉尔夫·费因斯 Ralph Fiennes 饰）爱上了表亲薇勒瑞（詹妮弗·艾莉 Jennifer Ehle 饰），并且不顾家人的反对娶其为妻，甚至为了仕途而抛弃了家族的姓氏，彻底和亲人决裂。最终，伊格纳茨勃勃的野心不仅伤害 了薇勒瑞，亦让他自己疲惫不堪。 亚当（Sándor Szakácsi 饰）是伊格纳茨的小儿子，面对前程，他做出了和父亲相同的选择，然而，纳粹分子对犹太人的仇恨彻底粉粹了他对未来的幻想和希望。亚当的儿子伊万（马克·斯特朗 Mark Strong 饰）幸运的成为了那场惨无人道的屠杀中的幸存者，可是，仇恨和厌世冲昏了他的头脑，使得他冲动的投入到了社会主义运动之中去。

历经艰辛刚摆脱非洲土人的追杀，飞鹰Jackie（成龙）就接到伯爵的急电，要其迅速赶到西班牙。二战末期，知道自己来日不多的德国纳粹把在欧洲抢掠所得的数万吨黄金隐藏在了非洲撒哈拉大沙漠一个秘密基地，伯爵急电Jackie，正是要其配合冷艳的考古专家Ada（郑裕玲）再赴非洲寻找这批黄金，途中，藏金副官的外孙女Elsa加入寻宝队伍。费尽艰辛终抵大沙漠后，Jackie一行人于一次意外无意发现了藏金基地，而就在他们欣喜若狂之际，一个神秘大汉突然出现，一场生死博斗遂即展开。

一切のエンターテイメント性を排したストイックかつ格調高い宮本武蔵。戦時下末期の制作で、溝口ならではの超辛口な演出です。

竜神の滝近くにそそりたつ断崖で刃を交える机竜之助（市川雷蔵）と宇津木兵馬（本郷功次郎）。盲目の竜之助は断崖から落下するが、お豊（中村玉緒）に助けられる。お豊はやがて廓に身を沈めた後、病に侵され自害して果てるが、竜之助はそんなお豊の死に対して、少しの動揺も見せなかった。東海道を東へ向かう竜之助は道中、生け花の師匠・お絹（阿井美千子）と出会う。お絹は道中師・がんりきの百（小林勝彦）に狙われており、竜之助は百の右腕を斬り落すが、誤って谷底へ転落してしまう。竜之助はお徳（矢島ひろ子）によって助けられ、お徳から甲府勤番の旗本・神尾主膳（島田竜三）の強引なゆすりの話を聞き、主膳の宿へ乗り込むが捕縛され、逆に幽閉されしまう。ある夜、主膳は色と欲から有野村の馬大尽の一人娘・お銀（中村玉緒）に迫るが、お銀は竜之助に助けを求めた。お銀の顔にはむごたらしい火傷の後があった。だがその声に、お豊、お浜の面影を感じた竜之助はお銀を連れて大菩薩峠に舞い戻る。豪雨で笛吹川が氾濫を起こす中、竜之助はお浜との間に出来た息子・郁太郎を求めてさまよう。そして竜之助の噂を聞きつけた兵馬もまた大菩薩峠へ向かう。決着の時が近づいていた…。