故事梗概：月晦风高夜，国舅府发生命案，周国舅名丧蒙面杀手。国舅爷遇刺，朝廷震怒，后宫总管太监孙值传旨，着左督御史方谨限期破案。方谨把查案的任务交给铁飞花时，委婉转达孙公公对铁飞花与七彩门关系甚密的猜疑。国舅的死，能让孙公公怀疑到铁飞花身上，铁飞花自然不敢怠慢。铁飞花请得尚方宝剑，带上柳儿直奔杭州大富杨智峰而来。铁飞花记得，不久前处理汪江洋汪公公时，七彩门四当家的双飞燕曾经说过，杭州大富杨智峰有可能就是七彩门门主曾同。铁飞花住进杨府，希望能在杨府守株待兔。入夜，黑衣蒙面人飞镖传帖，明言将在端午节那天取杨智峰性命。同时得到帖子的，还有杨府的后厨花二狗。花二狗将帖子呈送杨智峰，以此讨好，借机为杨智峰七夫人丽君的婢女采菱赎身。杨智峰顺水推舟，寻常人自然看不出什么破绽，但铁飞花却从中发现端倪。除了花二狗，杨智峰的贴身护卫赵蛟、帐房游先生，都值得怀疑。赵蛟和杨智峰的六夫人两心相许。六夫人一直希望赵蛟能替她血洗杀父之仇；游先生掌管杨智峰的来往帐款，深知杨智峰与杭州知府官盐私办的秘密。数天的静观其变，铁飞花断定，七彩门门主就在杨府，至于谁是曾同，铁飞花暂时还没有定断。接下来的几天，杨府先后发生几起离奇事件，先是杨智峰因过失伤人被提刑按察使陈清明抓走，然后是杨府发现七彩门的牌符，紧接着是西厂给铁飞花施压，目的是想把铁飞花赶出杨府。林林总总，纠缠缕析，铁飞花从杨智峰的障眼法中清醒地看到，行刺周国舅的幕后主使、七彩门门主就是花二狗、杨智峰、游先生中的一个。端午节，杨智峰、花二狗、赵蛟、游先生各怀心事。六夫人悬梁自尽，激怒赵蛟，赵蛟持剑直指杨智峰；花二狗为七彩门名册，致杨智峰于死地。铁飞花迟到一步，杨智峰倒毕一旁；花二狗咽气前，手指游先生的方向；赵蛟闻悉六夫人的死，悲愤自杀。一切似乎都已经结束，铁飞花突然想到游先生，中途将其截下，最终拿到七彩门名册。名册上赫然写着：七彩门门主：杨智峰。

阿尔文史崔特先生（理查德·法恩斯沃斯 Richard Farnsworth 饰）已经七十多岁了，他不仅个性孤僻古怪，视力状况也每况愈下。史崔特先生和女儿罗斯（茜茜·斯派塞克 Sissy Spacek 饰）相依为命，父女两人的日子虽然过得清贫，但也不失宁静和乐趣。哥哥莱尔（哈利·戴恩·斯坦通 Harry Dean Stanton 饰）病重的消息打破了史崔特先生家中的平静气氛。虽然由于曾经的矛盾，兄弟两人已经将近十年没有见过面了，但如今史崔特先生已然步入了老年，经历过生命力的种种变幻和无常，史崔特先生决定，是时修补一下兄弟之间的裂痕了。就这样，史崔特先生驾驶着自己的割草机上路了，目的地是300英里之外的威斯康辛州。

两个情同姐妹的女中学生毕业后各奔前程：富家女独居别墅，贫家女进了训练班。贫家女的男友家明爱上了富家女，富家女出于道义婉拒；但在圣诞夜由于孤寂，两人发生了关系，事后富家女因内疚而自暴自弃。贫家女发现家明根本不喜欢自己，全心全意投入训练班的训练，取得优异成绩。但富家女没有出席她的毕业晚会，待她找到富家女的家里，只见富家女已经溺毙在游泳池中。

某日，一群使用风遁之术的空忍空袭火之国，无数民众和忍者遇害，形势危急。据纲手大人所言，这群不速之客正是在第二次忍者大战中落败的空之团，如今他们怀着复仇之心再次出现。卡卡西（井上和彦 配音）等人则负责侦查空之团的老巢，鸣人（竹内顺子 配音）、小樱（中村千绘 配音）、雏田（水樹奈々 配音）受命组成三人医疗小队，协助名医神农（石塚運昇 配音）前往其徒弟雨琉的家乡医治伤者。另一方面，病入膏肓的大蛇丸得知神农的再生之术业已完成，他命佐助（杉山纪彰 配音）前去寻找神农。这也促成佐助和昔日伙伴宿命的重逢……本片为《火影忍者》第五部剧场版动画。