医药公司老板钱程斥资建立了一座位于密林深处的生物制药研究实验室，通过改造鲨鱼的基因来研制一种新型的抗癌药物，然而就在该药物即将大量投入生产时，一场巨大的危机也悄然降临：由于更改了鲨鱼的基因致使其基因突变性情凶猛，并展现出其它生物的特征，虽然研究员叶歆及时向上级反馈，但老板钱程置若罔闻，下令继续加紧实验，没想到危机爆发。

ある日、沖縄の海に奇怪な生物が現れた。オニヒトデを思わせる「それ」は毒液で漁師を負傷させ、瞬く間に日本全域に広がった。それは伝説のニライカナイの古代文明が環境汚染の解決の為の生体浄化システムとして生み出したが、暴走したために結果としてニライカナイの滅亡の一因となった怪獣ダガーラの復活の前兆であった。エリアス姉妹は地球の危機を察知して石垣島へ飛ぶと、そこにはニライカナイから来た小生物ゴーゴが出現し、その尾の装飾リングから宝がある事を悟った本土からの密猟者と、ゴーゴを保護した地元の少女たちがいた。エリアス姉妹は「ニライカナイの遺跡にはダガーラを倒す秘宝がある」という伝説を知っていた。少女たちとエリアス姉妹、そして姉妹と対立する黒い妖精ベルベラと密猟者はそれぞれ組んで海へ出る。ゴーゴの手引きでニライカナイの遺跡であるピラミッドが海から出現した。だが、宝捜しをしている頃、石垣島にダガーラが上陸し暴れ出したため、エリアス姉妹はモスラを召喚して戦いを挑む。ダガーラとモスラは石垣島から西表島まで空中戦を繰り広げ、遺跡のピラミッド付近で海中戦となり、モスラは海での戦いを得意とするダガーラに海に引きずり込まれた。そしてダガーラは「それ」 = 無数のベーレムをモスラに取り付かせ、モスラは戦闘不能に陥った。エリアスは必死にモスラに取り付いたベーレムを剥がそうと試みるが、あまりにも沢山付いているため、全くきりがない。絶体絶命のピンチに陥ったモスラ、宝の発見は急務となった。遺跡の中のトラップをくぐり抜けた少女たちと密猟者は、辿りついたホールでニライカナイの王女の立体映像から「ゴーゴが宝の主として少女 = 汐里を選んだ」事を告げられる。だが、ダガーラはピラミッドを襲撃してきた! 崩壊するピラミッドの最中、モスラはゴーゴの「命の水」の力により、取り付いたベーレムは取り払われ、さらにレインボーモスラとなってパワーアップし、再びダガーラと再戦する。さっきまでの状況とは一変し、今度はモスラが優位に立った。ダガーラが再び海中に潜った時、モスラはアクアモスラに変身し、戦いの舞台は、海底に移った。ダガーラの攻撃をバリアーでガードし、ダガーラに強力な攻撃を与えるモスラ。さらに分身モードとなり、ダガーラの体内から、ベーレムを倒しながら攻撃し、遂にダガーラは倒れ、その後、ピラミッドと共に消滅。モスラも海から出てきた後、元の姿のレインボーモスラに戻り、インファント島に帰って行き、危機は去ったのであった。

高中生潔西卡、班尼、迪安、艾瑞克和琳達，打算用手機拍攝他們的冒險經歷影片，只為了能在社群網站上獲得人氣。他們決定潛入一間有名的廢棄公寓，琳達說服管理員讓他們進去後，五人發現了一間被警用封鎖線圍起來的公寓，在好奇心驅使下他們闖入了公寓。他們四處搜索，並在房間裡發現了一張老舊的牛皮紙，身為唯一看得懂牛皮紙上文字的人，琳達朗讀紙上咒語，一個神秘的入口突然出現…五人發現自己無意間打開了通往神秘世界的入口，不僅如此，還觸怒了守護入口的超自然生物⋯。一場變調的試膽大會，喚醒了驚悚的靈異殺機，現在他們心中只剩下對死亡的恐懼、與回家的渴望……

私立晨光学院町田高中，群体作弊事件严重，校园暴力引发胡搅蛮缠的家长与教师的连锁冲突，体育教师柴原彻郎（山田孝之 饰）和美术教师久米刚毅（平岳大 饰）的不端行为又令这一神圣职业蒙羞。在这片无序的混乱中，二年4班班主任莲实圣司（伊藤英明 饰）继续他那完美纯然的教师神话。举止优雅，谦和可亲，天使一般的外表下竟是一颗冷冰冰的恶魔之心。他潜心经营，布下一个又一个不易察觉的圈套，悄无声息抹除那些威胁他存在的人们。物理教师钓井（吹越满 饰）暗中调查莲实的过去和背景，并与他的学生圭介（染谷将太 饰）等人尝试揭穿莲实的真面目，此举全引来连番血腥杀戮。充满欢乐的校园祭前夜，血流成河……本片根据作家贵志祐介的同名原著改编。